Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20517G3UVU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20517G3UVU6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms