Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XntrpcF8VQM8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
XntrpcF8VQM8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XntrpcF8VQM8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms