Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp946F6VWU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp946F6VWU8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms