Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Syngap1F6SEU4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syngap1F6SEU4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syngap1F6SEU4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms