Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Pik3c2bE9QAN8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pik3c2bE9QAN8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pik3c2bE9QAN8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pik3c2bE9QAN8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms