Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdc1E9Q5K9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ythdc1E9Q5K9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc1E9Q5K9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms