Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3Z1

B230217C12Rik, RIKEN cDNA B230217C12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230217C12RikE9Q3Z1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.05■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B230217C12RikE9Q3Z1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
B230217C12RikE9Q3Z1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms