Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FgaE9PV24 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FgaE9PV24 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FgaE9PV24 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms