Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930558K02RikE0CXC6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930558K02RikE0CXC6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930558K02RikE0CXC6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms