Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms