Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lonrf1D3YY23 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lonrf1D3YY23 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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