Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim30cD3YVI9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms