Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rfx8D3YU81 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rfx8D3YU81 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rfx8D3YU81 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
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