Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pnldc1B2RXZ1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pnldc1B2RXZ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pnldc1B2RXZ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms