Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AU015836B2RUM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AU015836B2RUM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AU015836B2RUM3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms