Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttc38A3KMP2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc38A3KMP2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc38A3KMP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms