Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Btbd35f28A2CFD5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Btbd35f28A2CFD5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Btbd35f28A2CFD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms