Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Patl2A2ARM1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Patl2A2ARM1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Patl2A2ARM1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms