Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syndig1A2ANU3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syndig1A2ANU3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syndig1A2ANU3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms