Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn34c4A2ANA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34c4A2ANA3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34c4A2ANA3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms