Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc163A2AGD7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc163A2AGD7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms