Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2dnl2A2AFH2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ube2dnl2A2AFH2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms