Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm5938A2AEN9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm5938A2AEN9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm5938A2AEN9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms