Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4921501E09RikA0A0R4J054 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4921501E09RikA0A0R4J054 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4921501E09RikA0A0R4J054 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms