Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Trbv26A0A0B4J1P5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trbv26A0A0B4J1P5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Trbv26A0A0B4J1P5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trbv26A0A0B4J1P5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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