Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YVX8

Ighv5-2, Immunoglobulin heavy variable 5-2 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ighv5-2A0A0A6YVX8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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