Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmod4Q9JLH8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms