Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms