Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Trim39Q9ESN2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trim39Q9ESN2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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