Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rabl3Q9D4V7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms