Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg12Q9CQY1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atg12Q9CQY1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms