Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms