Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ssc5dQ8BV57 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssc5dQ8BV57 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms