Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrfn4Q80XU8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrfn4Q80XU8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms