Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm6899Q3USS0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6899Q3USS0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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