Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Siah1bQ06985 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms