Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Apoc2Q05020 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Apoc2Q05020 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms