Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm45714-201ENSMUST00000211466 2722 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Bfar-202ENSMUST00000069281 2456 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm35288-201ENSMUST00000216565 2731 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rps28P62858 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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