Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Rab4aP56371 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Rab4aP56371 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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