Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ptx3P48759 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms