Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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