Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18530 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P18530 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P18530 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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