Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cited2O35740 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Cited2O35740 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cited2O35740 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cited2O35740 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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