Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pagr1bF6V0H0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pagr1bF6V0H0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms