Protein–RNA interactions for Protein: E9QAI8

Gm3460, Predicted gene 3460, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3460E9QAI8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3460E9QAI8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms