Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col4a3Q9QZS0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Col4a3Q9QZS0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a3Q9QZS0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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