Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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