Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FancaQ9JL70 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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FancaQ9JL70 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FancaQ9JL70 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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FancaQ9JL70 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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FancaQ9JL70 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FancaQ9JL70 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms