Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SelenofQ9ERR7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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