Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4bQ9D8B3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms